GIMP/インデックス・レイヤーにはしきい値操作はできません - kobapan @ wiki

「インデックス・レイヤーにはしきい値操作はできません。」と表示され操作できなかったら、

[画像(I)][モード(M)]で「インデックス」となっているのを、「RGB」または「グレースケール」に変更する。