| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | もくてき | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| カネゴンのマネーロード | 2 | 30分 | 1000 | ザイゴを30体倒す | カネゴン商会と宇宙キャラバンのアイテムが2割引で買えるようになる | 所持金を一度でも10万G以上にしてからカネゴンと話す | 固定装備(カネゴンボード&ゴルドン防具) |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| ライバルからの試練 | 1 | 5分 | 1000 | ゲスラを倒す | ヒールキットS5個、ヒールキットM3個、 ヒールキットL1個、APリカバーS5個、 APリカバーM3個 |
「第3のキング」クリア後、ラルバと話す | ゲスラは通常よりも弱い |
| 小さき反応 | 1 | 5分 | 1000 | ピグモンの救出 | ピグモン乗船 | 「レラトーニの調査」「ライバルからの試練」 クリア後、ゴウと話す |
マップ左端の小島→マップ右上の高台 →マップ中央の池周辺の順に移動する 出現するレッドキングは倒さなくても良い |
| 音速の戦い | 1 | 3分 | 1000 | レッドキングを倒す | 高出力スラスター (ハカセに渡すとEXボード入手) |
「ライバルからの試練」クリア後で ボードを5回使用後、トニーと話す |
装備限定(ボード) |
| ロックオン | 3 | 30分 | 1000 | 高速ロボフォーを倒す | ロングバレル (ハカセに渡すとEXバズーカ入手) |
「よみがえる怪獣」クリア後で ロボフォーのデータポイント100以上で バズーカを5回使用後、マツナガと話す |
装備限定(バズーカ)。夜間マップ マップ全体に重力あり アンチグラヴィは使用不可 |
| ターゲットをねらえ | 3 | 30分 | 1000 | ゲスラ２体と 巨大ゲスラを倒す |
EXハンドガン | 「鉄のガーディアン」クリア後で ハンドガン5回使用後、ラルバと話す |
固定装備（科学特捜隊一式&バトルガン） 最初のゲスラは通常よりも弱い |
| 電波のうず | 5 | 30分 | 1000 | 恐竜戦車、ロボフォー、 キングジョー、 インペライザーを倒す |
「星人科学ぶき研究①」 「星人科学ぶき研究②」が研究に追加 |
「鉄のガーディアン」クリア後でメトロン星人乗船後、 レベル5以上（エンディング後ならこの限りではない） のアブドゥルと話す |
夜間マップ |
| 真剣勝負 | 4 | 30分 | 1000 | ザムシャーを倒す | EXブレード | 「神のけしん」出現後で ブレード5回使用後、ザムシャーと話す |
装備限定(ブレード)。夜間マップ アイテムは使えない |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| 最高のサポート | 4 | 30分 | 1000 | バルタン星人を倒す | バーニアキット (ハカセに渡すとEXキャリア入手) |
「バルタンだましい」出現後でキャリア5回使用後、ハルと話す | 装備限定(キャリア) |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| アペヌイからのSOS | 1 | 30分 | 1000 | ジャミラの救出 | ジャミラ乗船 | 「死をよぶ赤いあんさつしゃ」「火の鳥」「いかりにもえるはかいしゃ」クリア | マップ中央左上の部屋の左側窪みにいる |
| むてきのガッツ星人 | 2 | 10分 | 1000 | ブラックキングを倒す | ガッツ星人乗船 | 「宇宙忍者しゅうらい」出現後、ザラブ星人と話す | |
| 赤き川と黒き大地 | 3 | 5分 | 1000 | EXレッドキングを倒す | メトロン星人乗船 | 「しのびよるツワモノ」出現後でガッツ星人乗船後、ザラブ星人と話す | |
| ノーバVSメトロン？ | 3 | 30分 | 1000 | ノーバを倒す | EXアーム | 「ふるえる電ゲキ」出現後でアーム5回使用後、メトロン星人と話す | 固定装備(メトロンアーム、メトロンスーツ) |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| マッスルハンマー | 3 | 30分 | 1000 | タイラントを倒す | 重心バランサー (ハカセに渡すとEXハンマー入手) マッスルスーツレシピ |
「氷のてっつい」出現後でピグモン乗船後で ハンマー5回使用後、ゴウと話す |
固定装備(ブレイブハンマー、マッスルスーツ) |
| スナイパーへの道 | 3 | 30分 | 1000 | ミニ恐竜戦車を倒す | EXバスター | バスター5回使用後、レベル6以上 （エンディング後ならこの限りではない）のダダと話す |
装備限定(バスター) |
| むてきの用心棒 | 3 | 30分 | 1000 | ブラックキングを倒す | ばくらいのもんよう | 3種類のバードンをそれぞれ3体以上倒した後、ガッツ星人と話す |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| ジャングルの深緑 | 2 | 30分 | 1000 | ソリチュラを倒す | ダダ乗船 | ピリカ解放後でソリチュラのデータポイント100以上で「レラトーニの夜間調査」出現後、ミズキと話す |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| ドクをもってドクをせいす | 3 | 30分 | 1000 | エレキング(毒)を倒す | リボルバーソード (ハカセに渡すとEXソード入手) |
「ブラックサンダー」出現後でソード5回使用後、リクと話す | 装備限定(ソード) 開始時は毒状態 ポイズンエイド、トータルエイドは使用不可 パワードバギーに乗れば毒は治る |
| 超進化ゴモラ | 4 | 30分 | 1000G | ゴモラ(METEOR)を倒す | 「とくしゅぼうぐ研究」が研究に追加 | 「せいあつする鉄人」出現後でブースカ乗船後、レベル5以上 （エンディング後ならこの限りではない）のサカモトと話す |
|
| フリーズ・ロック | 3 | 30分 | 1000 | バルンガを冷凍保存する | ミッションクリア時に得られる データポイントが+30される |
ダダのレベルが6以上でハカセの特別メニュー「転送システムの研究」 終了後にゴウからフリーズロックの説明を受けた状態で （エンディング後なら条件はダダ乗船のみ）ミズキと話す |
バルンガを普通に倒すと失敗 |
| ワッカのおいしい水 | 2 | 30分 | 1000 | ソリチュラを倒す | 2Ｆにペガッサのバーがオープンする | 宇宙人が3人以上乗船した後でペガッサ星人と話す | |
| 電ゲキからのSOS | 3 | 30分 | 1000 | エレキングを倒す | ピット星人乗船 | 「電ゲキ大作戦」クリア後でエレキングのデータポイント100以上 | |
| ブースカのお願い | 3 | 30分 | 1000 | スペースタートルを5体倒す | せいうんのもんよう | ミズキ、アブドゥル、サカモト、アヤノ、リク、ハルの 6人全員からアクセサリーをもらった後 （エンディング後ならこの限りではない）、ブースカと話す |
| ミッション名 | ランク | 時間 | お金 | 目的 | クリアボーナス | 出現条件 | 備考 |
| データこそすべて | 3 | 30分 | 1000 | 全てのボス怪獣を倒す | 研究費が3割カットになる | シシダ乗船後でガッツ星人のレベルが6以上の時、レベル5以上 （エンディング後なら条件はガッツ星人乗船のみ）のアヤノと話す |
ベムスター、ゴモラ(氷)、レッドキング(氷)、 バードン(氷)、アントラー(白)、ノーバ(白)、 恐竜戦車(雪迷彩)のうち4体がランダムで出現 常時電磁波状態 アンチジャマーは使用不可 氷塊を壊せば通信回復 |
